Przewidywanie struktur łańcucha RNA to poważne wyzwanie algorytmiczne dla osób zajmujących się biotechnologią. Nie tylko sekwencja danego łańcucha RNA, ale także jego przestrzenna struktura mają ogromny wpływ na właściwości biologiczne danej molekuły. Specyficzne uporządkowanie przestrzenne może umożliwiać przyłączenie się do łańcucha innych molekuł. Przedstawionych zostanie kilka algorytmicznych metod pozwalających na przewidywanie trójwymiarowego uporządkowania łańcucha RNA.